uzvestnik КОЙЯШ РАСУЛ Рестриктазы, разрезающие ДНК на фрагменты Методы решения задач ▍ Справка о ферментах EcoR I — разрывает 10 связей: 2 фосфодиэфирные между Г–А и 8 водородных между А– Т. Г | А А Т Т Ц Ц Т Т А А | Г Hae III — разрывает только 2 фосфодиэфирные связи между Г–Ц. Г Г | Ц Ц Ц Ц | Г Г BamH I — разрывает 12 связей: 2 фосфодиэфирные между Г–Г и 10 водородных (6 — Ц–Г, 4 — А–Т). Г | Г А Т Ц Ц Ц Ц Т А Г | Г Задача. 2 молекулы ДНК: первая разделена рестриктазой EcoR I, вторая — BamH I, всего получено 15 фрагментов. Если разница в количестве водородных связей 1 между исходными молекулами ДНК и разделёнными на фрагменты составляет 116, на сколько фрагментов разделила EcoR I? Решение. Если получено 15 фрагментов, значит разрезов было 13. x — число разрезов EcoR I → рвёт 8 Н-связей; y — число разрезов BamH I → рвёт 10 Н-связей. После разрезов количество Н-связей уменьшилось на 116. x + y = 13 8x + 10y = 116 ───────────────────── x=7, y=6 —1— Telegram: @master_biochemistry • YouTube: Мастер биохимик • Instagram: Расул Косимович uzvestnik КОЙЯШ РАСУЛ Ответ. EcoR I разрезала 7 раз, значит образовалось 8 фрагментов. Задача. 2 молекулы ДНК: первая разделена рестриктазой EcoR I, вторая — BamH I, всего получено 15 фрагментов. Если разница в количестве водородных связей 2 между исходными молекулами ДНК и разделёнными на фрагменты составляет 116, сколько водородных связей было разрезано между А–Т? Решение. EcoR I: Г | А А Т Т Ц → 8 Н-связей Ц Т Т А А | Г BamH I: Г | Г А Т Ц Ц → 10 Н-связей Ц Ц Т А Г | Г Всего 15 фрагментов → рестриктаз 13. Так как молекул две, каждый разрез образует новый фрагмент. Из системы 8x + 10y = 116 и x + y = 13 получаем x = 7, y = 6. 7 × 8 = 56 — в EcoR I на 4 связи приходятся А–Т, 6 × 4 = 24 — в BamH I на 1 пару А–Т, 56 + 24 = 80 Ответ. В ДНК разрезано 80 водородных связей между А и Т. Задача. Рестриктаза EcoR I распознаёт последовательность Г‑А‑А‑Т‑Т‑Ц и разрезает связи между Г и А. В специальных условиях молекула ДНК длиной 110,5 нм была разделена рестриктазой EcoR I на фрагменты A, B, C. Общее 3 количество водородных связей во всех образовавшихся фрагментах ДНК на 2 % меньше их количества в исходной молекуле. Если расстояние между соседними нуклеотидами 0,34 nm, сколько водородных связей во фрагментах (A, B, C) расположено между нуклеотидами Г и Ц? Способ 1. Система уравнений 1) G - A - A - T - T - C ||| || || || || ||| C - T - T - A - A - G —2— Telegram: @master_biochemistry • YouTube: Мастер биохимик • Instagram: Расул Косимович uzvestnik КОЙЯШ РАСУЛ 2) Одна рестриктаза разрывает 8 Н-связей. Чтобы получить фрагменты A | B | C, нужно 2 разреза. 3) 2 × 8 = 16 Н-связей уходит. 4) 16 : 0,02 = 800 Н-связей в исходной ДНК. 5) 110,5 : 0,34 = 325 пар нуклеотидов; всего 325 × 2 = 650 нуклеотидов. 2x + 2y = 650 2x + 3y = 800 ───────────────────── x = 175 , y = 150 ⇒ Г–Ц: 3y = 450 Способ 2. Метод креста (диагональный) Слева — крайние варианты: если бы ДНК была целиком А–Т (650) или целиком Г–Ц (975). В центре — реальное число Н-связей. 650 ↘ 175 800 975 ↗ 150 справа: 175 — пар А–Т, 150 — пар Г–Ц; 150 × 3 = 450 Н-связей Г–Ц. Ответ. Между Г и Ц во фрагментах имеется 450 водородных связей. Задача. В определённых условиях молекула ДНК длиной 105,4 нм была разделена ферментом BamH I на фрагменты A, B, C, D. Если общее количество 4 водородных связей во всех образовавшихся фрагментах на 3,75 % меньше их количества в исходной молекуле, найдите количество водородных связей между Г–Ц в исходной молекуле ДНК. Способ 1. Система уравнений 1) BamH I разрывает 10 Н-связей за 1 разрез; для 4 фрагментов — 3 разреза ⇒ 3 × 10 = 30 Н-связей. 2) 30 : 0,0375 = 800 Н-связей в исходной ДНК. 3) 105,4 : 0,34 = 310; всего нуклеотидов 310 × 2 = 620. 2x + 2y = 620 —3— Telegram: @master_biochemistry • YouTube: Мастер биохимик • Instagram: Расул Косимович uzvestnik КОЙЯШ РАСУЛ 2x + 3y = 800 ───────────────────── x = 130 , y = 180 ⇒ Г–Ц: 3y = 540 Способ 2. Метод креста (диагональный) 620 ↘ 130 800 930 ↗ 180 справа: 130 — пар А–Т, 180 — пар Г–Ц; 180 × 3 = 540. Ответ. Водородных связей между Г и Ц — 540. Задача. В определённых условиях молекула ДНК длиной 105,4 нм была разделена ферментом BamH I на фрагменты A, B, C, D. Если общее количество 5 водородных связей во всех образовавшихся фрагментах на 3,75 % меньше их количества в исходной молекуле, найдите количество водородных связей между Г–Ц в исходной молекуле ДНК. Решение. 1) 105,4 : 0,34 = 310 нуклеотидов в одной цепи (всего 620 шт.). 2) BamH I за 1 разрез рвёт 10 Н-связей; для получения фрагментов A / B / C / D нужно 3 разреза: 1 разрез → 10 Н-связей, 3 разреза → x = 30 Н-связей. 3) Если 30 Н-связей — это 3,75 %, то 100 % составляет x = (30 × 100) : 3,75 = 800 Н- связей. 4) Составляем систему: 2x + 2y = 620 2x + 3y = 800 ───────────────────── x = 130 , y = 180 × 3 = 540 Ответ. Количество водородных связей Г–Ц в исходной молекуле ДНК равно 540. —4— Telegram: @master_biochemistry • YouTube: Мастер биохимик • Instagram: Расул Косимович uzvestnik КОЙЯШ РАСУЛ Задачи для самостоятельного решения Задача. В определённых условиях молекула ДНК длиной 102 нм разделена рестриктазой BamH I на фрагменты A, B, C, D. Если в процессе разделения 1 количество исходных Н-связей уменьшилось на 4 %, сколько Н-связей между А и Т было разорвано в образовавшихся фрагментах ДНК? Задача. Определённая молекула ДНК, состоящая из 150 нуклеотидов, обработана рестриктазой EcoR I и разделена на фрагменты A, B, C. Если 2 количество Н-связей в ней уменьшилось на 8 %, определите количество аминокислот в белке, синтезированном с исходной ДНК. Задача. 2 молекулы ДНК: первая разделена рестриктазой EcoR I, вторая — BamH I, всего получено 15 фрагментов. Если разница в количестве водородных связей 3 между исходными молекулами ДНК и разделёнными на фрагменты составляет 116, сколько водородных связей было разрезано между А–Т? Задача. 2 молекулы ДНК: первая разделена рестриктазой EcoR I, вторая — BamH I, всего получено 15 фрагментов. Если разница в количестве водородных связей 4 между исходными молекулами ДНК и разделёнными на фрагменты составляет 116, сколько водородных связей было разрезано между Г–Ц? Задача. При обработке ризосферы, выращенной в чашке Петри, смесью неизвестных рестриктаз количество Н-связей в ДНК организма уменьшилось на 112. Учитывая, что рестриктазы, разрезающие фосфодиэфирные связи, 5 составили 33,33 % от общего числа рестриктаз, определите соотношение неизвестных рестриктаз. A) BamH I; 2 EcoR I B) Hae III; 2 EcoR I C) 2 BamH I; EcoR I D) 2 BamH I; 2 Hae III —5— Telegram: @master_biochemistry • YouTube: Мастер биохимик • Instagram: Расул Косимович